수술은 4세 이상부터 많이 합니다. 편도절제술은 재발성 편도염에서 가장 흔히 시행되며 이 경우 치료 효과가 좋습니다. 다른 치료법을 충분히 시도했음에도 불구하고 일년에 3~4회 이상 편도염이 재발하는 경우에 편도절제술을 시행할 수 있습니다. 편도비대로 인하여 치아부정교합이 생기거나 안면골 발달의 장애 가 생길 때에도 수술을 권할 수 있습니다. 항생제에 잘 반응하지 않는 편도주위농양이 생긴 경우 도 수술의 대상이 되는데, 대부분 급성기를 피해서 수술을 시행합니다.